مطالعة ساختار ژنتیکی اسب های بومی ایران با استفاده از توالی d-loop ژنوم میتوکندری

نویسندگان

میثاق مریدی

علی اکبر مسعودی

رسول واعظ ترشیزی

چکیده

در این مطالعه، به منظور آگاهی از ساختار ژنتیکی اسب های بومی ایران در مقایسه با نمونه های خارجی، نمونه های خون از 95 رأس اسب از جمعیت های متعدد نقاط مختلف کشور و 114 توالی d-loop میتوکندری از بانک اطلاعات ژنوم بدست آمد. dna کلیة نمونه های بومی با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شده و بعنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیة d-loop ژنوم میتوکندری بکار برده شدند. با آنالیز توالی قطعة 247 جفت بازی ناحیة d-loop ژنوم میتوکندری در نمونه های فوق، 44 هاپلوتیپ به همراه 39 جایگاه متغیر مشخص شد. در درخت فیلوژنی ترسیم شده برای این هاپلوتیپ ها به همراه توالی های بدست آمده از بانک اطلاعات ژنوم شش هاپلوگروه (a تا f) تشخیص داده شد. مقدار تنوع نوکلئوتیدی کل برای اسب های بومی ایران 009/0±028/0 بدست آمد. مقادیر شاخص تثبیت با استفاده از روش kimura-2 parameter دارای دامنه ای بین 001/0- الی 172/0 بودند. آنالیز واریانس مولکولی نشان داد که برخی از این جمعیت ها، بخصوص نمونه های اسب سیستانی، با سایر جمعیت های مورد مطالعه و همچنین با توالی های بدست آمده از بانک اطلاعات ژنوم قرابت ژنتیکی دارند (05/0>p). بین دو جمعیت عرب و ترکمن بدلیل عدم کنترل تلاقی های این دو جمعیت تفاوت معنی دار مشاهده نشد (05/0p >). دو جمعیت اسب کرد و اسبچة خزر با سایر جمعیت های مورد مطالعه و با توالی های بدست آمده از بانک اطلاعات ژنوم تفاوت معنی دار نشان دادند (05/0>p). به طورکلی نتایج بدست آمده در این مطالعه نشان دهندة تنوع ژنتیکی بالا و وجود شباهت ژنتیکی در برخی از جمعیت های مورد مطالعه می باشند. با توجه به این نتایج لزوم وجود کنترل تلاقی های جمعیت ها و کنترل تولید نتاج در جمعیت های اسب بومی کشور احساس می شود.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

مطالعة ساختار ژنتیکی اسب‌های بومی ایران با استفاده از توالی D-loop ژنوم میتوکندری

در این مطالعه، به منظور آگاهی از ساختار ژنتیکی اسب‌های بومی ایران در مقایسه با نمونه‌های خارجی، نمونه‌های خون از 95 رأس اسب از جمعیت‌های متعدد نقاط مختلف کشور و 114 توالی D-loop میتوکندری از بانک اطلاعات ژنوم بدست آمد. DNA کلیة نمونه‌های بومی با استفاده از روش شستشوی نمکی استخراج شده و بعنوان الگو برای تکثیر و تعیین توالی ناحیة D-loop ژنوم میتوکندری بکار برده شدند. با آنالیز توالی قطعة 247 جفت ...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان بومی فارس بر مبنای توالی‌یابی بخشی از ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری

Native chickens are considered as national genetic resources and their conservation is very important from biodiversity aspects. The study of mitochondrial genome in one breed and comparing it with others can be a useful index for genetic diversity in that population. This study carried out for determining the sequences of mitochondrial high variable 1 (HVR-I) of D-loop region in Fars native c...

متن کامل

مطالعه ساختار ژنتیکی پایکای افغانی (Ochotona rufescens) با استفاده از توالی ناحیه D-Loop ژنوم میتوکندریایی در خراسان شمالی

در پژوهش حاضر، با استفاده از ناحیه D-Loop میتوکندریایی، تنوع ژنتیکی پایکای افغانی (Ochotona rufescens) در بین چهار جمعیت مختلف در استان خراسان شمالی بررسی و تحلیل شد. به این منظور، تعداد 16 فرد (4 فرد از هر جمعیت) از چهار منطقه حفاظت شده (قرخود، گلول-سرانی، سالوک و ساریگل) جمع‌آوری و پژوهش‌های آزمایشگاهی انجام شد. عوامل ژنتیکی بین و درون جمعیت‌های پایکا از قبیل تنوع ژنتیکی و نوکلئوتیدی، تفاوت ه...

متن کامل

ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغان بومی فارس بر مبنای توالی یابی بخشی از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری

چکیده طیور بومی از ذخایر مهم ژنتیکی به شمار می روند که به عنوان سرمایه های ژنتیکی ملی مطرح هستند و نگهداری آن ها از نظر حفظ تنوع زیستی بسیار با اهمیت است. امروزه با کشف توالی¬های موجود در میتوکندری امکان بررسی ژن¬های کنترل کننده موجود در این اندامک به عنوان یکی از دیدگاه¬های جدید و مهم مطالعات ژنتیکی در آمده است. بررسی ژنوم میتوکندری در یک نژاد و مقایسه آن با سایر نژادها می تواند شاخص مناس...

15 صفحه اول

ارزیابی تنوع ژنتیکی مرغ بومی دشتیاری بر مبنای توالی یابی بخشی از ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری

. این مطالعه به منظور تعیین توالی بخش hvr-iاز ناحیه d-loop ژنوم میتوکندری مرغ دشتیاری بومی ایران، تعیین میزان تنوع موجود در این جمعیت و ترسیم رابطه فیلوژنی آن با سایر نژادهای مرغ انجام گرفت. در این تحقیق تعداد 20 نمونه مرغ بومی دشتیاری مورد بررسی قرار گرفت. توالی 455 نوکلئوتید برای تجزیه و تحلیل مورد استفاده قرار گرفت. پس از استخراج dna با استفاده از پرایمرهای اختصاصی، قطعه مورد نظر به طول 450 ...

بررسی تنوع ژنتیکی لاک پشت دریایی منقار عقابی (Eretmochelys imbricata) موجود در دو جزیره کیش و قشم با استفاده از تعیین توالی ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری

به منظور مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت لاک پشت منقار عقابی (Eretmochelys imbricata) در دو جزیره خلیج فارس با استفاده از تعیین توالی ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری، 40عدد جنین مرده لاک پشت از دو جزیره قشم و کیش جمع آوری گردید. حدود bp890 از ناحیه D-loop ژنوم میتوکندری تکثیر و تعیین توالی شد. در این مطالعه 5 محل (مکان) پلی مورف و 6 ه...

متن کامل

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید


عنوان ژورنال:
علوم دامی ایران

ناشر: پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران

ISSN 2008-4773

دوره 43

شماره 2 2012

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023